過濾精度不同。濾筒除塵器的過濾精度通常更高，濾筒除塵器的過濾精度可以達到0.1微米，甚至更高，而布袋除塵器的過濾精度一般為5到10微米，即使經過復合處理，最小精度也只能達到1微米左右。

過濾材質不同。濾筒除塵器使用的濾料通常是折疊成圓筒狀的聚酯纖維、納米纖維、木漿紙等，表面可能經過PTFE、阻燃、防靜電、防油防水等特殊處理，具有更大的過濾面積、更高的除塵效率和更低的阻力。布袋除塵器則主要使用軟質濾料縫制成的布袋，濾料種類較多，包括滌綸、PE、丙綸、PP、PPS、P84、PTFE等。

應用和維護成本不同。濾筒除塵器的成本通常高于布袋除塵器，主要是由于其特殊的過濾材質和結構。濾筒除塵器的電磁閥和操控成本相對較高，而且由于其體積較小，制造過程中使用的材料成本也較高。雖然濾筒除塵器的初期投資較高，但其維護成本較低，因為其結構簡單，減少了更換濾袋的頻率。

體積大小不同。在相同的過濾面積條件下，濾筒除塵器的體積通常比布袋除塵器小約1/3以上。

應用場合不同。布袋除塵器適用于高溫、高濃度的粉塵處理，能在惡劣工況下作業；濾筒除塵器更適合處理低濃度、高精度的細小粉塵，能達到更高的排放標準